Pri toplotnih črpalkah je cena pogosto največja ovira za tiste, ki iščejo nov ogrevalni sistem, a so pri tem zelo pozorni na svoje končno zadovoljstvo in izkoristek svoje investicije. To je seveda povsem pričakovano, saj ogrevalne sisteme najlažje primerjamo prav po tem, koliko denarja bo treba nameniti za nakup in vgradnjo opreme. Cena toplotne črpalke je lahko v tem primeru velika ovira, saj so stroški relativno visoki – morda bo treba odšteti kar desetkrat več kot za kakšen drug sistem. Ni pa nujno, da bo res tako, prav tako ni nujno, da visoki stroški niso upravičeni.
Na voljo imamo nekatere precej ugodne toplotne črpalke, ki se lahko tudi po stroških ob nakupu in vgradnji kosajo z alternativnimi ogrevalnimi sistemi. To je recimo toplotna črpalka zrak voda, ki velja za najcenejšo izvedbo. Po delovanju je sorodna klimatskim napravam, kar pomeni, da so tudi cene primerljive s takšno opremo. Toplotna črpalka zrak voda je zelo ugodna tudi zato, ker vgradnja ne terja velikih gradbenih posegov. Opravka imamo z elegantno zunanjo enoto, ki se lahko namesti praktično kamorkoli, pa tudi povezava z notranjo enoto ni posebej zahtevna. Tako je cena toplotne črpalke v izhodišču precej nizka, morda bo znašala le kakšnih tisoč evrov ali celo manj, če ne potrebujemo posebej zmogljive naprave. Seveda bo naprednejša toplotna črpalka zrak voda nekoliko dražja, kar je pričakovati, če nameravamo uspešno ogrevati večje prostore v mrzlih zimah.
Predvsem pa je cena toplotne črpalke relevantna na dolgi rok, takrat se namreč pokažejo prednosti takšnih varčnih sistemov. Na dolgi rok imamo opravka predvsem s stroški, ki jih predstavlja poraba energije – pri toplotnih črpalkah je to električna energija, ki skrbi za poganjanje črpalke, medtem ko je energija, ki jo za ogrevanje pridobivamo iz okolja, praktično brezplačna. Na srečo bo tudi električna energija zelo poceni, saj je poraba nizka.